O PTCRIS é o resultado de uma recomendação formulada no âmbito de um trabalho de consultadoria comissionado pelo Conselho Diretivo da FCT à equipa técnica da Unidade FCCN (na sequência da fusão desta com a FCT). Este trabalho concluiu que as necessidades de gestão de ciência e tecnologia vão além da missão dos sistemas de informação de suporte ao negócio da FCT (a gestão do financiamento), sendo fundamental uma visão mais abrangente que envolva todos os agentes da comunidade científica nacional e internacional sob a forma de um ecossistema nacional integrado de ciência e tecnologia.